Là một phần của công nghệ mới nổi thì quy tắc an toàn trong sử dụng UAV còn đang ở tình trạng chưa hoàn thiện, đặc biệt là ở các nước chưa phát triển.

Các đe dọa mất an toàn trực tiếp liên quan đến sự cố khi bay thì bị rơi, có thể gây tai nạn thương tích, chết người hoặc cháy nổ. Nguy cơ này càng tăng khi UAV bay trên vùng trang trại rộng, được sử dụng nhiều lần nhưng bảo dưỡng không đảm bảo chất lượng. Ngoài ra UAV có thể bị mất kiểm soát hoặc bị cướp quyền điều khiển (hacked), rồi bay vào các vùng nhạy cảm như vùng cất hạ cánh của máy bay [7]. Va chạm drone với máy bay đã từng xảy ra, lần đầu tiên được ghi nhận năm 2017 ở Canada [8].

Tại Hoa Kỳ khi drone bắt đầu sử dụng trong nông nghiệp, Cục Hàng không Liên bang (viết tắt là FAA, Federal Aviation Administration) lúc đầu đã khuyến khích nông dân sử dụng công nghệ mới này để hỗ trợ theo dõi hoạt động trang trại. Tuy nhiên, với sự bùng nổ thành công của drone, FAA đã nhanh chóng rút lại lời khuyến khích đó cho đến khi có thể đưa ra các quy tắc và quy định. Với nhiều sự cố như drone rơi vào bụi cây, FAA và AFBF (American Farm Bureau Federation) đã cùng nhau hình thành các quy định về cho phép sử dụng drone hoạt động một cách an toàn và hiệu quả trong nông nghiệp. Sự cộng tác giữa AFBF với FAA trong việc điều chỉnh một số hạn chế đã được thực hiện, dẫn đến ngành nông nghiệp có thể sử dụng máy móc mới này một cách an toàn.